How I did it
Come utilizzare un immagine come canale alfa di un'altra.
Per la seguente procedura e' stato utilizzato Gimp 2.2.12 per Linux
- Immagine originale (64x128 pixel) composta dall'icona vera e propria e da quello che diventera' il suo canale alfa

- seleziono la parte superiore (64x64 pixel)

- taglio (Ctrl+x) la selezione

- dal menu Immagine -> Autoritaglio immagine

- incollo (Ctrl+v)

- dal menu Livello -> Nuovo livello (in modo che la "Selezione fluttuante" diventi un nuovo "Livello incollato")

- seleziono il livello contenente quello che sarà il canale alfa ("Sfondo")

- dal menu Livello -> Trasparenza -> Colore ad alfa -> Ok

- dal menu Livello -> Trasparenza -> Alfa a selezione

- seleziono nuovamente il "Livello incollato"

- cancello (Ctrl+k)

- seleziono di nuovo il livello "Sfondo" e lo cancello

- salvo il risultato come immagine .tga o .png o .gif

sfondo: rosso verde blu bianco nero
(su Internet Explorer la trasparenza delle immagini png non e' ancora stata implementata correttamente)
P.S. Ringrazio il prezioso suggerimento di johnJ di gimpitalia.it senza il quale non sarei mai riuscito ad ottenere il risultato cercato